磷酸酶（phosphatase）是一種能夠將對應底物去磷酸化的酶，即通過水解磷酸單酯將底物分子上的磷酸基團除去，并生成磷酸根離子和自由的羥基。磷酸酶的作用與激酶的作用正相反，激酶是磷酸化酶，可以利用能量分子，如ATP，將磷酸基團加到對應底物分子上。在許多生物體中都普遍存在的一種磷酸酶是堿性磷酸酶。

催化機制

半胱氨酸依賴的磷酸酶通過形成磷酸－半胱氨酸中間體來催化磷酸酯鍵的斷裂，具體過程如下(以磷酸化的酪氨酸去磷酸化過程為例，參見右圖)：

首先，酶活性位點上的自由的半胱氨酸親核基團進攻磷酸基團中的磷原子并成鍵；然后，連接磷酸基團與酪氨酸的P-O鍵接受位置合適的酸性氨基酸(如天冬氨酸)或水分子所提供的質子，發生質子化，從而形成磷酸－半胱氨酸中間體；這一中間體被另一個水分子所水解，酶的活性位點被釋放，可以繼續下一個去磷酸化反應。

金屬磷酸酶的活性位點上結合了兩個催化所必需的金屬離子。而對于這兩個金屬離子的性質的研究結果并不一致，因此到目前為止還沒有定論。現有的證據只能夠表明，這兩種金屬可以是鎂、錳、鐵、鋅的任意組合，并且兩個金屬離子之間通過一個氫氧根離子相連。目前認為這一氫氧根離子參與了對磷的親核攻擊。

堿性磷酸酶的作用

堿性磷酸酶(alkaline phosphatase , EC 3 .1 .3 .1 ,AP)是非特異性磷酸單酯酶, 可以催化幾乎所有的磷酸單酯的水解反應, 生成無機磷酸和相應的醇、酚、糖等, 還可以催化磷酸基團的轉移反應, 且大腸桿菌A P 還是一種依賴亞磷酸鹽的氫化酶。AP 存在于除高等植物外幾乎所有的生物體內, 可直接參加磷代謝, 在鈣、磷的消化、吸收、分泌及骨化過程中發揮了重要的作用。

應用

堿性磷酸酶（AP）在醫學和分子生物學等領域有廣泛的用途。在臨床醫學上, 測定血清中AP 的活力已成為診斷和監測多種疾病重要手段。AP 主要用于阻塞性黃疸、原發性肝癌、繼發性肝癌、膽汁淤積性肝炎等的檢查, 患這些疾病時, 肝細胞過度制造AP , 經淋巴道和肝竇進入血液, 同時由于肝內膽道膽汁排泄障礙, 反流入血而引起血清AP 明顯升高。